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霊長類の祖先の化石は約6500万年前、白亜紀末期頃に見つかった。他の哺乳類と同様、約3500万年前には現代型霊長類に代わっている。2つのグループ、今のキツネザル類・ロリス類グループと、メガネザル類と真猿類（ヒト・類人猿・旧世界ザル・新世界ザルを含む）グループの祖先が発見されている。現生霊長類のうち、真猿類以外のものを原猿類と呼ぶ。キツネザル類はマダガスカル島のみに、ロリス類はアフリカ大陸と東南アジア、メガネザル類は東南アジアに生息している。
旧大陸の真猿類は、ニホンザルなどを含む旧世界ザルと類人猿やヒトを含むホミノイドの２つのグループに分かれて進化した。この二つのグループが分岐したのは、約3000〜2500万年前と考えられている。化石記録から見ると最初はホミノイドの方が繁栄していたが、約1000万年前から旧世界ザルが勢力を増してその比率は逆転した。現在ではヒト以外のホミノイド（すなわち類人猿）はほとんど絶滅寸前である。
旧世界ザルとホミノイドは集団で生活する。他のサルは単独生活である。これらのサルはアフリカ大陸に出現した後、ユーラシア大陸に進出した。
約500万年前のアフリカの東部は今よりもずっと雨が多く、湿潤な森林であった。たくさんの類人猿がグループで生活していた。ゴリラはハーレムをつくる。これに対してチンパンジーは、複数のオスが複数のメスと暮らす。東南アジアの類人猿であるオランウータンやテナガザルは単独で生活する。人類の祖先は東南アジアでは発見されないので、人類の祖先（猿人）はアフリカ類人猿型の社会生活を送ったと予想される。いずれも樹上生活者で木登りが上手である。樹上では外敵も少なく、食物連鎖の上位にいたと思われる。
アフリカの類人猿は実ができる木とその季節を熟知し、芋が育つ空き地を知り、食用になるキノコや多くの甲虫の幼虫が棲息する倒木の位置を知っていた。自分たちの群れが食料を調達するのが得意な場所を縄張りとしてあちこちをリーダーに率いられて移動した。時には新天地に移動したこともあったろう。群れを単位にして進化に必要な隔離が成立したと考えられる。群れにより遺伝子プールがすこしずつ変動する。生活環境が重なるので、異種も含めて群れの間で競合があった。
直立二足歩行と犬歯の縮小が類人猿と人類を分ける特徴とされている。
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ダーウィン進化論は、発表以来、１世紀半にわたってさまざまな反対学説に鍛えられました。この説の基礎は、
○すべての種には変異がある。
○生物は生き残れる以上の子を作る。
○その環境に好ましい変異を持つ子が最も生き残って繁殖していく。
という３つです。シンプルなこの原則で非常に多くの現象が説明できます。しかし、人為的なイメージが付け加えられて、誤解を招くことがあります。
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代表的なのは、人はサルから進化した、という表現です。正確には人「も」サルから進化した、です。今、生きている猿も人と同じようにサルの進化形です。なお、サルとカタカナにしているのは学問的な種を意識しています。祖先形のサルは現在は生き残っていないので、学問上の仮定の種に相当します。同様に、全部絶滅してしまいましたが、サルから進化した他のヒト（化石人類）もたくさんいます。人類は枝がたくさんある樹のように進化したはずで、我々はその一部を化石として発見しています。現存するヒト科の動物は現生人ただ１種です。他の種は現生種が滅ぼしたと思われます。
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進化論の誤解その二。進化は進歩と同じではない。例えば、退化も進化です。極端な例は動物の腸内に寄生する寄生虫。彼らは全身から栄養分を吸収する仕組みを持ち、ひたすら増えることを目的として生きています。また、宿主の免疫の攻撃から逃れるための方策を講じています。そのほかの仕組みはすべて捨ててしまいました。必要な特徴を大幅に発達させる一方で、不必要なものを切り捨てた個体が種の中で生き残りやすくなる。何から何まで有利に発達させられればすばらしいですが、大きさや強度など物質的な制約や、栄養の取得や排泄、遺伝子の維持など生理的な限界もあるので、可能な選択肢の中から有利なものを選ばざるを得ません。優秀な種、力の強い種が生き残るのではありません。環境で有利な種が生き残るのです。
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人類の進化について書かれた文章をだいぶ読みましたが、「＊＊＊に使用したので形態が変化した（発達した）」という表現がたくさんありました。例えば、道具を使ったから脳が発達したという記述はたくさんありました。進化論の考え方は順番が逆です。まず、遺伝子が変化して形態が変わり、「＊＊＊に有利になった」結果、その形態を持つ（つまりその遺伝子を持つ）個体が選択されたのです。鍛錬した形質が子孫に伝わった科学的な証拠はありませんし、伝える仕組みもありません。正確な表現に気をつけていないと論理が逆になってしまいます。
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進化の原動力は環境の変化です。葉や小枝にそっくりな昆虫は擬態の好例で、ダーウィン進化論の格好の証拠です。虫を葉に似せたのは、自律的ではなく、捕食者である第三者の関与しか考えられない。第三者の関与が環境です。そして繰り返しになりますが、擬態の良し悪しは優秀さではなく、有利さです。機能面からすればむしろ劣ることもあります。孔雀の羽の進化に見られる性選択も、メスがオスを選ぶことで一見不利のような形質が進化しました。
有利さによる選別を自然選択と呼びます。生物はいつも弱い選択圧を受けていますが、いつも生き残るために競争しているわけではありません。広大なサバンナにはシマウマも、レイヨウも、エランドも、インパラも、オリックスも、アンテロープも、ヌーもいます。ライオンをはじめネコ科動物も６種もいます。珊瑚礁に限らず、海の中は多様な魚類で一杯です。同じ環境を共有していてもただ1種類の種だけが生き残るわけではないのです。生きる隙（間）があれば、新しい種が生き残ります。生物は常に新しい種を生み出します。
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感染症の進化は共生の仕方と捉えることができます。
ロベルト・コッホ以来、感染症の病態は主に病原体に原因があると理解されてきました。急性で致死性の感染症の場合はそれでよかったのですが、現在のように、エイズや結核などの慢性の感染症が問題となると、慢性の感染症は病原体のみならず、宿主側の免疫に依存することが解ってきました。C型肝炎ウィルスやエイズウイルスは感染者の体内で小さな変異を繰り返し、免疫系から逃れます。最近の成果では、免疫系からの逃避や競争という受動的な方法のみならず、ウイルスがむしろ免疫系に積極的に働きかけ、共生関係を創り出す生き残り戦略があることも分かってきました。
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体内での相利共生は、寄生者と宿主の間の巧妙な関係によって成り立っています。出会いの初めは一方がもう一方を利用するという関係、偏利共生関係です。宿主は寄生者によって被害を受けます。しかし、偏利共生は、お互いの適応戦略の果てに相利共生へと進化したと考えるのは自然な仮説でしょう。遺伝子の塩基配列を利用した分子系統樹による種分化の研究によりこの仮説に有利な証拠が集まってきました。偏利共生から相利共生へと双方が進化する過程で、寄生者の宿主に対する有害な影響は少なくなっていくという過程が生じるはずです。それに応じて、宿主の寄生者に対する攻撃も和らいでくるはずです。
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病原体は宿主に対して有害な影響を及ぼす典型例です。宿主との関係が始まったばかりでは激烈な症状を持って、宿主を発病させ、殺します。やがては、有害性は低下するか消滅し、長い年月の間には、宿主と共生する方向に進化する例がいくつかあります。
出会いは新しい環境に宿主が入り込んだときに、また、寄生者が新しい伝播方法を獲得した場合に起きます。アフリカでエボラウイルスがときどき発生しますが、それは人類がジャングルに進出したためと考えられています。ウイルスが変化して人間に感染するようになった例も東南アジアやオーストラリアで報告され、また、鶏インフルエンザウイルスではその可能性が検証されつつあります。
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ポーランドのＳＦ作家にスタニスラフ・レム（ハヤカワ文庫ではスタニスワフ・レム）がいます。代表作は映画化された「ソラリスの陽のもとに」と思いますが、同じように印象に残っているのは「砂漠の惑星」です。ある惑星に置き去りにされた機械が独自に進化したという設定です。最終的は昆虫のような小さな機械が優勢種となりました。猛烈な繁殖力で巨大な高性能マシーン、大きな火力を持つ兵器を凌駕しました。イナゴの大発生（蝗禍）や蟻の大群に襲われること（黒い絨毯という映画がありました）をイメージしてもらえればいいと思います。地球からやってきた探検隊の最期も。。。
共生関係を考慮しない設定ですので、単純化された力関係が描かれています。また、免疫系のメカニズムが解っていない時代でしたから、巨大機械は作家によって十分な防備装置を与えられなかったのでしょう。もっとも、現代の機械装置も免疫系は装備していません。
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種の分類は交配可能かどうかが判断基準です。遺伝子の交雑がなくなれば独立した生物として分類されます。遺伝子の交雑を阻むものは何でしょう。たとえば、地理的な障壁。海、谷、山。水中にすむ生物にしてみれば陸が障壁です。生理的な障壁。精子と卵子が融合できるか。精子と卵子ができるときに減数分裂が確実にできるか。言い換えると、染色体が相同か。繁殖をする場所、時期、季節が同じか。一年中発情期なのはチンパンジーと人間くらいです。オスとメスの間で認識するシグナル（フェロモン）の種類が同じか。
海の中は陸上に比べて環境は一定なのに、生物種の数は地上を上回ります。海生生物の特徴でしょうか。海は広いからでしょうか？ 海の中は立体的に広がっていて、平面で分割すると数十倍になり、同じ面積に見えても広さは莫大なものになります。
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人類を特徴付ける二足歩行自体はそれほど異常なことではありません。鳥類や恐竜は二足歩行です。カンガルーなどもいます。二本足で安定して立つことと鎖骨があるかないかは関連します。もともと、鳥類や恐竜、ネズミのような哺乳類は鎖骨が発達しています。鎖骨は前肢と背骨とを連結しています。サルやネズミも鎖骨を持ちます。一方、牛、馬、犬など、大部分の哺乳類である四足動物は鎖骨がなく、前肢は背骨と独立しています。前足は後ろ足で蹴って前に進んだ体の着地に使われます。もし、前足と背骨がつながっていると着地の際には体重の数倍もの力が直接、前足に加わることになります。鎖骨は折れるか、大きなダメージを受けるでしょう。四足動物では前足が筋肉だけで体躯とつながっているので、着地のときに筋肉がばねの役割を果たし、衝撃を吸収するのです。四足歩行する哺乳類では鎖骨があると走るのに不利なため、鎖骨がない動物が生き残ったのです。
鎖骨を持つ動物は4本足で疾駆することができなくなりました。草原では不利です。しかし、鎖骨によって手が体躯に固定されるので、前肢が手としての動きができます。後ろ足で立つと、自由になった前肢を利用して餌を採取したり、木の枝をつかむことができます。ネズミやリスなどを思い浮かべてください。そして、樹上をフィールドとするサルでは「つかむ」四肢が発達しました。リスなどの小動物では樹皮を爪で掴んで移動する能力が発達しました。いずれも四肢で草原を疾駆するのとは違う用途です。
その点から見ると人間の足は前肢は掴む足であり、後足は走る足です。両方の特徴を併せ持ったといえるでしょう。
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人類が生み出された基本単位は群れと思います。群れには固有の遺伝子プールがあり、その違いは身体的な能力の差に現れ、群れの発展や衰退に影響したと思われます。また、長い年月の間に得意とするフィールドが群れによって違ってきて種の分離を生み出す隔離が成立したでしょう。
類人猿がいても東南アジアでは人類につながるような猿人の化石は発見されていません。ただ、発見されていないだけかもしれません。アフリカの大地溝帯を中心とした地域からのみ古い人類の化石が発見されています。しかし、そこに人類の祖先が出現したという証拠ではありません。そこに生存していた証拠です。大地溝帯は地層が口を開き、乾燥しているために植生も少なく、政治的に安定しているため調査隊も入りやすいという化石探しの好条件が重なっています。アフリカの他の地域にも猿人の化石が出土する可能性があり、その化石は人類の初期の進化について、考え方を変える証拠となるかもしれません。
つづく
